日常生活中，中西药的联合应用日趋广泛，但若配伍不当或不合理，或盲目联合相加，药物间可发生相互作用，影响疗效或产生不良后果。
不良反应相加，毒副作用增大。酸性较强的中药如成药保和丸、五味子、乌梅丸等，不宜与磺胺类药物合用，因为磺胺类药能与酸性药物代谢物反应加重结晶尿、血尿的形成。夏枯草、百茅根、泽泻中药含钾量较高，不宜与保钾利尿药安体舒通、氨苯喋啶合用，因能引起高血钾的副作用。中药杏仁、桃仁的中成药，因其含腈甙，若与西药的麻醉药、镇静药合用，可抑制呼吸中枢，并对肝脏有害。
妨碍药物吸收，降低疗效。血余炭、芥穗炭、棕榈炭、煅龙骨、煅牡蛎等炭煅类中药，若与助消化如药乳酶生、多酶片、胃蛋白酶、胰酶等合用，则会妨碍这些药物的吸收，影响疗效。中药甘草制剂若与常用治疗炎性疾病的抗生素如红霉素、四环素、利福平等合用，也会影响药物吸收并降低疗效，以致炎症久治不愈。
改变酸碱度，降低疗效。含有维生素C、枸橼酸、苹果酸、酒石酸的中成药，如山楂丸、保和丸、六味地黄丸等，能降低胃液的PH值，增加胃液的酸度，如同时服胰酶、淀粉酶，则使其活性受到抑制;碱性物质的中成药，如婴儿散、通窍散、大黄苏打片等，服后胃肠道PH值升高，碱性增强，若同时服胃蛋白酶、乳酶生，则使其活性受到抑制。
发生化学变化降低疗效。中成药朱砂安神丸，天王补心丹等不宜与含碘化钾、溴化钾的药物合用。牛黄解毒片内含石膏，四环素内含有酰胺基和多个酚羟基，若同时服用可在肠道内形成难以吸收的络合物，降低四环素的生物利用度。含大量鞣质的中药如五倍子、地榆等，不宜与酶制剂如胃酶、淀粉酶、多酶片等合用。
破坏有效成分，降低疗效。抗生素类西药不宜与含有神曲、麦芽、豆蔻、砂仁、莱服子等药如保和丸、消食片、香砂养胃丸等同服;含有大黄的中成药如清宁片、牛黄解毒片、麻仁丸等也能与抑制酶类药物的作用，不能与乳酶生、多酶片等酶类药合用。
药物相互拮抗，降低疗效。含有犀角、珍珠的中成药如犀角丸、珍珠丸等，不宜与黄连素合用;甘草、鹿茸及其中成药含有糖皮质样物质，有升高血糖的作用，不能与降血糖优降糖、降糖灵等合用，以免产生拮抗。中成药止咳喘膏、麻杏石甘片、川贝精片等含有麻黄，其主要成分麻黄碱可升高血压，若与抗高血压药联用，可相互拮抗而影响降压效果。
